Dalam kiprah dunia pendidikan, Yayasan Perguruan Ibnu Khaldun mendirikan 4 (empat) lembaga pendidikan yang tidak bersamaan. Pada awalnya Yayasan Perguruan Ibnu Khaldun mendirikan Institut Agama Islam (IAI) pada tahun 1972, kemudian pada tahun 1976, Yayasan Perguruan Ibnu Khaldun mendirikan Sekolah Menengah Pertama (SMP), dilanjutkan pada tahun 1987 mendirikan Madrasah Tsanawiyah (MTs). Pada Tahun 1991, Yayasan Perguruan Ibnu Khaldun mendirikan SMEA yang berubah menjadi SMK pada tahun 1992.